More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2481 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  475  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  59.91 
 
 		 261 aa  270  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  59.33 
 
 		 250 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3356  TetR family transcriptional regulator  58.25 
 
 		 247 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224117 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 219 aa  219  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 230 aa  179  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 245 aa  174  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 235 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 232 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 250 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 250 aa  141  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  40.7 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  23.64 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  45.45 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2128  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  25 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3590  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1460  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1492  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2113  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.473372  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0796  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3699  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
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NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
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NC_009075  BURPS668_A0479  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.676411  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_1758  transcriptional regulator of TetR family protein  24.56 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.77056  normal  1 
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0381  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_1000  regulatory protein, TetR  32.28 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6882 
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A1810  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0683  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3426  putative transcriptional regulator  30.92 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1818  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671958  normal  0.199135 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  24.53 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1121  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1158  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4844  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0185  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141931  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  24.2 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1598  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535122  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40380  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6233  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275362  normal  0.0744328 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2064  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  33.61 
 
 		 184 aa  57  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5968  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.609129 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5724  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  29.58 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1587  TetR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6709  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.408759  normal  0.497229 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1709  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.400859  normal  0.0301663 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.71 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5551  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1306  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_0594  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0201579  normal  1 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
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NC_010501  PputW619_4569  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000245113  hitchhiker  0.00602594 
 
 
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NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
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NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
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