More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4330 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  477  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  61.23 
 
 		 244 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  60.34 
 
 		 244 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  61.93 
 
 		 232 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 245 aa  158  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 261 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  40.27 
 
 		 250 aa  131  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 250 aa  131  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3356  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224117 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  40.7 
 
 		 233 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 219 aa  128  9.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.33 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2692  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 324 aa  61.6  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.67 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.67 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  21.26 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.67 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.67 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  23.24 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1426  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.67 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1492  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2619  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0796  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2113  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.473372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1810  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0381  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2128  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  23.92 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0479  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.676411  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  30.45 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1598  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535122  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6233  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275362  normal  0.0744328 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  30.45 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6709  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.408759  normal  0.497229 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5968  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.609129 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  23.39 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5724  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  31.34 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  25.58 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 216 aa  57  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1537  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  27.04 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0590  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1083  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0384  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4844  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  38.61 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6653  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713495  normal  0.0271875 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  35.46 
 
 		 194 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 291 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3641  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.7 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5348  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.130352 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  36.51 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.51 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.51 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.51 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.51 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 213 aa  53.1  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  36.51 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.51 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.51 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>