More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2022 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
225 aa  463  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  40.67 
 
 
208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 
209 aa  149  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  33.49 
 
 
208 aa  97.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 
196 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  30.93 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  23.88 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  40.45 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  40.45 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 
212 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 
196 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  23.27 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
234 aa  65.1  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  31.19 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 
228 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 
213 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 
231 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  33.56 
 
 
241 aa  62.8  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 
204 aa  62.8  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
193 aa  62.8  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 
226 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  41.67 
 
 
205 aa  62.4  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
239 aa  62.4  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
212 aa  62.4  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
212 aa  62.4  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
212 aa  62.4  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 
205 aa  62  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
229 aa  62  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5974  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 
227 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0426648  hitchhiker  0.00085933 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  23.65 
 
 
245 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3949  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
212 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.549729 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
211 aa  61.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14520  Transcriptional regulator PsrA  53.06 
 
 
239 aa  60.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  54 
 
 
203 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1888  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
212 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 
231 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
212 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
212 aa  60.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4551  transcriptional regulator, N-terminus  58.33 
 
 
112 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
223 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 
235 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 
212 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 
230 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  30.43 
 
 
227 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
212 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
212 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 
201 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7459  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
233 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626167  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 
195 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
221 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
220 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 
227 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4065  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 
208 aa  59.3  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
220 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 
216 aa  59.3  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
218 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  24.37 
 
 
233 aa  59.3  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 
214 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
228 aa  59.3  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  53.06 
 
 
207 aa  59.3  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 
198 aa  58.9  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3282  regulatory protein, TetR  51.02 
 
 
238 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  39.73 
 
 
238 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
242 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  40 
 
 
221 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
196 aa  58.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
220 aa  58.5  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  30.7 
 
 
227 aa  58.9  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_3508  transcriptional regulator PsrA  51.02 
 
 
238 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 
211 aa  58.5  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 
231 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 
235 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.472704 
 
 
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NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  51.02 
 
 
233 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010338  Caul_0588  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
276 aa  58.2  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 
235 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 
258 aa  58.2  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal 
 
 
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NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
204 aa  58.2  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 
227 aa  58.2  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 
211 aa  58.5  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
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