More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2751 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  85.34 
 
 		 233 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  85.34 
 
 		 233 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  81.9 
 
 		 233 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  81.9 
 
 		 233 aa  390  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  81.9 
 
 		 233 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  81.47 
 
 		 233 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  81.03 
 
 		 232 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3590  TetR family transcriptional regulator  54.46 
 
 		 213 aa  204  8e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 226 aa  161  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1703  TetR family transcriptional regulator  75.24 
 
 		 106 aa  153  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  40.39 
 
 		 218 aa  148  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2064  TetR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 211 aa  146  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  37.75 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1758  transcriptional regulator of TetR family protein  33.98 
 
 		 220 aa  122  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.77056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  30.99 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  45.59 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  38.67 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  46.88 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4551  transcriptional regulator, N-terminus  43.33 
 
 		 112 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  43.33 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  48.33 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2564  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.454515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  30.1 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 277 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 275 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 213 aa  53.1  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 213 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  30.41 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  24.67 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 244 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
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NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 206 aa  52.8  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 258 aa  52.4  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0175  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 232 aa  52.4  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000233696  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 188 aa  52  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 258 aa  51.6  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal  1 
 
 
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NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
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NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_2291  transcriptional regulator, TetR family  22.99 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
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NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
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