More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3363 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  500  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 277 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 278 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 278 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 278 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  49.13 
 
 		 233 aa  218  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 275 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 275 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  50.45 
 
 		 283 aa  189  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1287  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.97 
 
 		 225 aa  101  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2999  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 235 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.64 
 
 		 236 aa  99.4  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.64 
 
 		 236 aa  99.4  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3249  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0882  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.41 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0854  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.41 
 
 		 224 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0914  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.41 
 
 		 224 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0967  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.41 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 235 aa  93.6  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4699  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0946  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.41 
 
 		 224 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00763  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.93 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.827218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2846  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0944  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.93 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0861  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.93 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0850  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.93 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  33.49 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2847  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.93 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0304787 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00780  hypothetical protein  30.93 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.978873  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_0819  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.93 
 
 		 223 aa  92  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.852921 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2556  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.41 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1794  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152901  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  28.86 
 
 		 253 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.48 
 
 		 232 aa  85.1  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2069  transcriptional regulator, TetR family  26.64 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.620568  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0326  transcriptional regulator, TetR family  26.64 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2883  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  0.331569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
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NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
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NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_3543  Transcriptional regulator TetR  30.37 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32802  normal  1 
 
 
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NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0462  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.573533  n/a   
 
 
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NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  52.73 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 227 aa  62  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 258 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 205 aa  62  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  41.89 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3905  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  41.77 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  36.63 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  37.23 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  27.96 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1684  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  29.33 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  43.1 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
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NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
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NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
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NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
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NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
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NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
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