More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4301 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 221 aa  454  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  40.2 
 
 		 209 aa  141  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 206 aa  124  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  30.24 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6452  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  54.17 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  28.65 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0590  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2619  transcriptional regulator, TetR family  44.34 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  34.73 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5046  putative transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  26.84 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5028  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  58.49 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_6717  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.477187  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
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NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5045  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1946  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  hitchhiker  0.00972871 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0718  transcriptional regulator, TetR family  51.39 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3290  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2081  transcriptional regulator, TetR family  36.91 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.586313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  46.58 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01016  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.64 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2629  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  47.83 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  46.05 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2582  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2112  transcriptional regulator RutR  28.64 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2305  transcriptional regulator RutR  28.64 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1128  transcriptional regulator RutR  28.64 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2354  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122941 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  46.05 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4234  transcriptional regulator, TetR family  41.59 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0811126  normal  0.324857 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 226 aa  62  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7126  transcriptional regulator, TetR family  37.69 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7595  transcriptional regulator TetR family  47.44 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1250  transcriptional regulator RutR  28.14 
 
 		 212 aa  62  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3888  transcriptional regulator, TetR family  46.74 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 224 aa  62  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2999  transcriptional regulator, TetR family  51.56 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3527  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal  0.540257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2247  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0116  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
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NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  28.49 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4577  transcriptional regulator, TetR family  41.44 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.957651 
 
 
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NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
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NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_2226  transcriptional regulator, TetR family  45.59 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407434  normal  1 
 
 
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NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
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NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
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NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1423  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.6699 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_1131  transcriptional regulator RutR  28.14 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.33999  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_6034  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008228  Patl_2423  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  23.28 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_2653  TetR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_2624  TetR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184874  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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