More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2354 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2354  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 184 aa  367  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_5046  putative transcriptional regulator, TetR family  50.62 
 
 		 193 aa  152  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2081  transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 		 193 aa  124  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.586313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2624  TetR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 186 aa  117  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184874  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2668  TetR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 186 aa  117  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.323955  normal  0.884032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2653  TetR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 186 aa  118  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0590  transcriptional regulator, TetR family  43.04 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6717  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.477187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5045  transcriptional regulator, TetR family  45.27 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2217  transcriptional regulator, TetR family  42.58 
 
 		 199 aa  108  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2619  transcriptional regulator, TetR family  38.17 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3888  transcriptional regulator, TetR family  44.53 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7126  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6452  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 264 aa  101  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5028  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 194 aa  101  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5223  putative transcriptional regulator, TetR family  49.59 
 
 		 186 aa  93.6  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.846379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3565  transcriptional regulator, TetR family  38.06 
 
 		 189 aa  90.9  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0847285  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4234  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0811126  normal  0.324857 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1946  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  hitchhiker  0.00972871 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0718  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4046  TetR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0577421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  41.28 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2226  transcriptional regulator, TetR family  41.12 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  40.19 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 225 aa  72  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  39.25 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  38.32 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0972  TetR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299865  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1929  TetR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1338  TetR family regulatory protein  42.27 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0307  TetR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.45423  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1024  TetR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.420909  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0841  TetR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1177  TetR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1185  TetR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193625  n/a   
 
 
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NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2348  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105911 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2244  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4577  transcriptional regulator, TetR family  41.96 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.957651 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  41.12 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  41.75 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 218 aa  64.3  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5245  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  38.18 
 
 		 224 aa  62  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122941 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 216 aa  61.2  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0116  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  35.65 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  31.72 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1587  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  36.75 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  57  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3949  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.549729 
 
 
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NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_0520  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627434 
 
 
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NC_009512  Pput_1888  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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