More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4234 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4234  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 192 aa  377  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0811126  normal  0.324857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7126  transcriptional regulator, TetR family  68.6 
 
 		 192 aa  241  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2619  transcriptional regulator, TetR family  44.67 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1946  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 191 aa  120  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  hitchhiker  0.00972871 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2217  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2081  transcriptional regulator, TetR family  44.94 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.586313 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5045  transcriptional regulator, TetR family  44.74 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0590  transcriptional regulator, TetR family  45.95 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2653  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 186 aa  94.7  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2624  TetR family transcriptional regulator  48.6 
 
 		 186 aa  94.7  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184874  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2668  TetR family transcriptional regulator  48.6 
 
 		 186 aa  94.7  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.323955  normal  0.884032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5028  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 194 aa  94  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2354  transcriptional regulator, TetR family  40.72 
 
 		 184 aa  92.4  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5223  putative transcriptional regulator, TetR family  54 
 
 		 186 aa  88.6  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.846379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5046  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 193 aa  88.2  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3565  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 189 aa  85.1  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0847285  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3888  transcriptional regulator, TetR family  35.5 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6452  transcriptional regulator, TetR family  35.86 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2226  transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6717  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 195 aa  77.8  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.477187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7595  transcriptional regulator TetR family  32.94 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4577  transcriptional regulator, TetR family  38.99 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.957651 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0125  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.493759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5245  transcriptional regulator, TetR family  30.24 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0972  TetR family transcriptional regulator  43 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299865  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1929  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1338  TetR family regulatory protein  42 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1185  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193625  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0307  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.45423  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1024  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.420909  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0841  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1177  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4046  TetR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0577421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2348  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105911 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  35.15 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2244  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0718  transcriptional regulator, TetR family  41.12 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  34.63 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  30.57 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  35.14 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  54.69 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 239 aa  62  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 233 aa  62  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  32.28 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  34.67 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 246 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  45.95 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122941 
 
 
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NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  29.12 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
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NC_007794  Saro_1587  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  42.45 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  44.59 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  42.45 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
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NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
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NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
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