More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7126 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7126  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 192 aa  384  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4234  transcriptional regulator, TetR family  69.23 
 
 		 192 aa  232  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0811126  normal  0.324857 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2619  transcriptional regulator, TetR family  48.1 
 
 		 192 aa  130  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1946  transcriptional regulator, TetR family  39.43 
 
 		 191 aa  128  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  hitchhiker  0.00972871 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2217  transcriptional regulator, TetR family  42.53 
 
 		 199 aa  124  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0590  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5028  transcriptional regulator, TetR family  44.16 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2354  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5045  transcriptional regulator, TetR family  38.92 
 
 		 198 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2081  transcriptional regulator, TetR family  40.61 
 
 		 193 aa  104  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.586313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6452  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 264 aa  98.2  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2624  TetR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184874  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2668  TetR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.323955  normal  0.884032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2653  TetR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5223  putative transcriptional regulator, TetR family  40.56 
 
 		 186 aa  94.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.846379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5046  putative transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 193 aa  91.3  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3565  transcriptional regulator, TetR family  39.35 
 
 		 189 aa  91.3  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0847285  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6717  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 195 aa  88.2  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.477187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3888  transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4577  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.957651 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0718  transcriptional regulator, TetR family  42.2 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2226  transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0125  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 238 aa  72  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.493759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 202 aa  72  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4046  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0577421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5245  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  34.29 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0116  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  32.51 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  64.3  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  30.36 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0972  TetR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299865  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1929  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1338  TetR family regulatory protein  37 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0307  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.45423  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5749  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1024  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.420909  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0841  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1177  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1185  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193625  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5516  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 224 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 224 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 221 aa  62  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 232 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 232 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 232 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 232 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 232 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 227 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  30.36 
 
 		 241 aa  61.2  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 241 aa  61.2  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2244  TetR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7595  transcriptional regulator TetR family  30.66 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  33.64 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  27.33 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  25.33 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2348  TetR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105911 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 241 aa  58.2  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  31.13 
 
 		 240 aa  58.2  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  24.83 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>