More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1946 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1946  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 191 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  hitchhiker  0.00972871 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2619  transcriptional regulator, TetR family  43.46 
 
 		 192 aa  131  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7126  transcriptional regulator, TetR family  39.88 
 
 		 192 aa  127  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5045  transcriptional regulator, TetR family  41.45 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4234  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0811126  normal  0.324857 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2217  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0590  transcriptional regulator, TetR family  44.3 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5046  putative transcriptional regulator, TetR family  43.71 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2081  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.586313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3565  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0847285  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5028  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6717  transcriptional regulator, TetR family  41.5 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.477187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5223  putative transcriptional regulator, TetR family  42.73 
 
 		 186 aa  97.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.846379 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2354  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 184 aa  89  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6452  transcriptional regulator, TetR family  34.66 
 
 		 264 aa  87.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4046  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0577421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2624  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184874  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2668  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.323955  normal  0.884032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2653  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 186 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3888  transcriptional regulator, TetR family  46.07 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0718  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4577  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.957651 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 210 aa  62  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0125  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.493759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 227 aa  62  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0116  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  45.54 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4904  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  34.11 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  34.11 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  44.78 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  25.62 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  44.07 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122941 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  31.54 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0142  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 288 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1036  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 288 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0169  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 321 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2773  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 321 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2630  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 321 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1313  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 321 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5245  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  37.31 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  40.24 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>