More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3411 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  407  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  53.19 
 
 		 209 aa  181  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 221 aa  124  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  47.83 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2619  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  57.69 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  57.69 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  57.69 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  28 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4551  transcriptional regulator, N-terminus  47.83 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  34.75 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5245  transcriptional regulator, TetR family  53.57 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0590  transcriptional regulator, TetR family  34.84 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  33.88 
 
 		 239 aa  62  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  44.74 
 
 		 228 aa  62  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  46.58 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2653  TetR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2624  TetR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184874  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2668  TetR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.323955  normal  0.884032 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1946  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  hitchhiker  0.00972871 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1794  TetR family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152901  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2064  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3565  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0847285  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  41.86 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4577  transcriptional regulator, TetR family  39.45 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.957651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 278 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 278 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 283 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 278 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  34.23 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  48.28 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4699  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5045  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  49.15 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  37.31 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122941 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6452  transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3249  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7126  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6717  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.477187  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>