More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B0474 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
212 aa  440  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  97.64 
 
 
212 aa  433  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  94.81 
 
 
212 aa  421  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  94.81 
 
 
212 aa  422  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  94.81 
 
 
212 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  94.34 
 
 
212 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  93.87 
 
 
212 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  91.51 
 
 
212 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  83.02 
 
 
212 aa  375  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4551  transcriptional regulator, N-terminus  93.58 
 
 
112 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4550  transcriptional regulator, C-terminus  88.54 
 
 
96 aa  185  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  27.65 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  57.69 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  34.26 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 
225 aa  64.7  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
239 aa  63.5  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
233 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
233 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
235 aa  62.8  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 
199 aa  62.4  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 
232 aa  62  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
233 aa  61.6  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 
209 aa  61.6  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0462  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
239 aa  61.2  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.573533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 
209 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
214 aa  59.7  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 
233 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  24.49 
 
 
201 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
245 aa  59.7  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
233 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
233 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
233 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
232 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  45.16 
 
 
236 aa  59.3  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  45.16 
 
 
236 aa  59.3  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
275 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 
189 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 
203 aa  58.9  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  23.74 
 
 
201 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 
223 aa  58.5  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  45.16 
 
 
232 aa  58.5  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  22.86 
 
 
201 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  23.28 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1794  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
229 aa  57.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152901  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
194 aa  57.8  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0928  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 
461 aa  57.4  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384359  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
283 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  23.02 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4749  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 
227 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 
206 aa  56.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 
200 aa  56.6  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 
211 aa  56.6  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
250 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 
206 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2746  regulatory protein TetR  43.55 
 
 
186 aa  56.2  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
189 aa  56.2  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
277 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 
189 aa  55.8  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 
186 aa  56.2  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
201 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 
201 aa  55.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 
201 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
201 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2712  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 
206 aa  55.8  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  35.29 
 
 
214 aa  55.5  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4186  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
195 aa  55.5  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 
249 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 
201 aa  55.5  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
234 aa  55.5  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1703  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
106 aa  55.1  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3508  transcriptional regulator PsrA  34.72 
 
 
238 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
235 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
235 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
291 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  33.33 
 
 
233 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 
218 aa  54.3  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 
278 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  33.33 
 
 
233 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02639  transcriptional regulator  35.82 
 
 
208 aa  54.7  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
228 aa  54.3  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
275 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
244 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3282  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 
238 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
235 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  44.23 
 
 
205 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  25.34 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>