More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0813 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  100 
 
 		 227 aa  473  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0392  transcriptional regulator, TetR family  62.8 
 
 		 213 aa  280  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 220 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  37.07 
 
 		 263 aa  119  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 239 aa  106  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1086  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 219 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.535417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 244 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1517  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 372 aa  84.7  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1870  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 220 aa  72  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  24 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  25 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  22.03 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  23.67 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  47.27 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  47.27 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  48.08 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2863  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0538  putative transcription regulator protein  42.11 
 
 		 340 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548249  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 277 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1794  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 229 aa  55.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152901  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 317 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 200 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 316 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  46.67 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 316 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 316 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
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NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2999  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
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NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  46.67 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  48 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4065  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 184 aa  53.1  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4256  regulatory protein TetR  34.78 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0418  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 352 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340149  hitchhiker  0.000146207 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3249  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 233 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 186 aa  53.1  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0433  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 354 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.425009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 227 aa  52.8  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4699  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 201 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 272 aa  52.4  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 247 aa  52.4  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 276 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 273 aa  52  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 212 aa  52  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3282  regulatory protein, TetR  45 
 
 		 238 aa  52  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 199 aa  52  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 202 aa  52  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 209 aa  52  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 220 aa  52  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 272 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_0819  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.48 
 
 		 223 aa  52  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.852921 
 
 
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NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 207 aa  52  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  22.67 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 221 aa  51.6  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 208 aa  51.6  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
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NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
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NC_010338  Caul_4603  TetR family transcriptional regulator  22.18 
 
 		 240 aa  51.6  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.488249 
 
 
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