More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2190 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 277 aa  559  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  84.17 
 
 		 278 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  84.17 
 
 		 278 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  84.17 
 
 		 278 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  75.45 
 
 		 275 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  74.73 
 
 		 275 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  73.24 
 
 		 283 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 244 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 233 aa  171  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1287  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.87 
 
 		 225 aa  106  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.88 
 
 		 232 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00763  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.48 
 
 		 223 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.827218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2846  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 223 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0861  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.48 
 
 		 223 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00780  hypothetical protein  31.48 
 
 		 223 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.978873  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2847  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.48 
 
 		 223 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0304787 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0850  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.48 
 
 		 223 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0944  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.48 
 
 		 223 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.46 
 
 		 236 aa  99  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.46 
 
 		 236 aa  99  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2556  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.02 
 
 		 223 aa  98.2  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0854  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.13 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0819  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.02 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.852921 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0946  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.13 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0914  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.13 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0882  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.13 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0967  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.66 
 
 		 224 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  30.35 
 
 		 226 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4699  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 234 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3249  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 233 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1794  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 229 aa  88.2  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152901  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2999  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 245 aa  87  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 249 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0462  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.573533  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  29.23 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  55.93 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0326  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2069  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.620568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5058  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3543  Transcriptional regulator TetR  27.59 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2883  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  0.331569 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  29.95 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  34.02 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4551  transcriptional regulator, N-terminus  34.41 
 
 		 112 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  45.61 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  43.86 
 
 		 216 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 216 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3290  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 212 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  45.71 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1703  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2365  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227272  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>