More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4901 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  415  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 225 aa  149  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  36.59 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  36.03 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  34.56 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 263 aa  68.2  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
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NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  27.38 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  23.21 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
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NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_5245  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 229 aa  64.7  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
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NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 234 aa  64.7  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
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NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  26.15 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  23.17 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  35.35 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 231 aa  62  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 238 aa  62  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 224 aa  62  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 240 aa  62  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 218 aa  62  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4551  transcriptional regulator, N-terminus  47.27 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3949  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.549729 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_1888  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122941 
 
 
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NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
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NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
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NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_2195  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
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NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
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