More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2904 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 263 aa  215  5e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 245 aa  146  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 239 aa  145  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1086  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.535417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 234 aa  144  9e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 218 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  37.86 
 
 		 244 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0392  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 213 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1517  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 372 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  34.15 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  32 
 
 		 219 aa  118  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1870  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 220 aa  106  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 235 aa  84.7  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3543  Transcriptional regulator TetR  34.97 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.19 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.19 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  32.28 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 272 aa  72  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 317 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4065  transcriptional regulator, TetR family  23.87 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4699  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310001  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 275 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  36.7 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1699  TetR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0964215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2863  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  28.02 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0819  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.4 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.852921 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00763  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.4 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.827218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2846  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00780  hypothetical protein  26.4 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.978873  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2847  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.4 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0304787 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0944  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.4 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0850  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.4 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0861  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.4 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 295 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2999  transcriptional regulator, TetR family  23.28 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.97 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2556  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.89 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3249  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1677  transcriptional regulator, TetR family  56.6 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.688428  normal  0.314033 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0538  putative transcription regulator protein  55.77 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548249  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1118  regulatory protein TetR  26.11 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  37.23 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5974  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0426648  hitchhiker  0.00085933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 235 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 235 aa  62  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 235 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  28.86 
 
 		 253 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1287  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.42 
 
 		 225 aa  62  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  46.77 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 250 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0433  transcriptional regulator, TetR family  55.77 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.425009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0418  transcriptional regulator, TetR family  55.77 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340149  hitchhiker  0.000146207 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4062  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
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NC_007347  Reut_A3446  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
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NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  56.36 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_3282  regulatory protein, TetR  46.43 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
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