More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3173 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  504  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  58.69 
 
 		 227 aa  268  5e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1086  TetR family transcriptional regulator  53.77 
 
 		 219 aa  229  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.535417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  52.07 
 
 		 220 aa  219  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  42.79 
 
 		 263 aa  168  6e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 218 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 239 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 213 aa  146  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1517  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 372 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  36.11 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0392  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 213 aa  125  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  33.33 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  30.58 
 
 		 227 aa  88.6  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  28.17 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0794  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 244 aa  72  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4065  transcriptional regulator, TetR family  23.7 
 
 		 208 aa  71.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0462  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.573533  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3543  Transcriptional regulator TetR  31 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 235 aa  67  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4699  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310001  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1118  regulatory protein TetR  34.06 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3249  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2999  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1870  transcriptional regulator, TetR family  25.96 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.97 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.97 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4569  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000147437  normal  0.0336832 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 196 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3988  regulatory protein, TetR  32.19 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100564  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2863  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.34 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5380  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768843  normal  0.61228 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  34.69 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1423  TetR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 209 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.6699 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1965  TetR family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 318 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  26.34 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 316 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 316 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 318 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 317 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 318 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  27.37 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 316 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 318 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  26.05 
 
 		 207 aa  55.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 283 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  27.11 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3370  transcriptional regulator, TetR family  24.49 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0063882  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  30.43 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3595  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5974  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0426648  hitchhiker  0.00085933 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 199 aa  53.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 215 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0944  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.14 
 
 		 223 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>