More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4405 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  99.61 
 
 		 259 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  99.61 
 
 		 259 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  64.92 
 
 		 257 aa  316  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  61.63 
 
 		 254 aa  298  6e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  64.26 
 
 		 237 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 250 aa  251  6e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  56.5 
 
 		 241 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  37.32 
 
 		 217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0727  transcriptional regulator, TetR family  39.25 
 
 		 216 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 290 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4909  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2817  transcriptional regulator, TetR family  41.06 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3329  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 217 aa  99.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181798  normal  0.116616 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3516  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3748  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3022  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  43.94 
 
 		 194 aa  62  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 193 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 194 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  44.78 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1493  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0527  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0974  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.543907  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1256  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259056 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3028  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.851198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3613  regulatory protein, TetR  38.75 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3816  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  45.95 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 199 aa  57  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1018  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 205 aa  57  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 194 aa  57  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4572  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  35.37 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 497 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1000  regulatory protein, TetR  22.68 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 196 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 195 aa  53.1  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 194 aa  53.5  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 220 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 211 aa  52.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 196 aa  52.8  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7459  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 233 aa  52.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 238 aa  52.8  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 179 aa  53.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 198 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 217 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 200 aa  52.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0511  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 194 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 206 aa  52  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  35.38 
 
 		 196 aa  52  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4844  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 252 aa  52  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 224 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 197 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 199 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2910  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 192 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  38.89 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>