More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0794 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0794  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 221 aa  461  1e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  31.21 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5058  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 244 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1086  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.535417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4065  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  24.54 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1118  regulatory protein TetR  45.45 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  41.67 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  26.53 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  28.17 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  44.64 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  37.5 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1870  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0392  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  28.16 
 
 		 246 aa  52.8  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  29.91 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 239 aa  52  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0462  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 239 aa  51.6  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.573533  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  36.45 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  45.28 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 264 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  42.11 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  42.11 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  25.15 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2863  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2515  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00143422  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  46.03 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1978  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000899637  hitchhiker  0.000000574301 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  36.36 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 275 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1517  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 372 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3590  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  32.33 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  26.53 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  40 
 
 		 232 aa  49.7  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 249 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  37.14 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.696599 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 239 aa  49.3  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 189 aa  49.3  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 242 aa  48.9  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 194 aa  49.3  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 275 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>