More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1079 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  441  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  36.15 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 209 aa  126  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1892  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000800916  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  46.56 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 195 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 195 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 198 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 208 aa  98.6  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  43.75 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 205 aa  91.7  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 176 aa  89.7  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 218 aa  86.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 257 aa  85.1  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 208 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  41.55 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  41.55 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  37.67 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  48.75 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  33.09 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  34.81 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4953  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 184 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281079  normal  0.71404 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 74 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  46.97 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  49.35 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  35.04 
 
 		 264 aa  68.6  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  50.63 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  27.32 
 
 		 230 aa  68.2  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 263 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  34.55 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1567  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  30.73 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 194 aa  62  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  43.42 
 
 		 245 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  31.9 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
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NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
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NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
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NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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