More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5527 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  398  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 205 aa  182  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  42.66 
 
 		 268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3621  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  51.43 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1000  regulatory protein, TetR  28.3 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  48.48 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  32.23 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  31.93 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1158  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 335 aa  58.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  41.41 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  32.82 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  49.25 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  31.07 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  22.79 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2038  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2746  regulatory protein TetR  22.79 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3297  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  32 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  37.5 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  37.5 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  48.78 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  31.46 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  37.5 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  45.61 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  45.61 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  22.77 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>