More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1005 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 218 aa  427  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17920  transcriptional regulator, tetR family  45.64 
 
 		 204 aa  146  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.330701  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 208 aa  111  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2290  transcriptional regulator, TetR family  36.68 
 
 		 208 aa  86.7  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0794358  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22560  transcriptional regulator, tetR family  38.1 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0880115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2079  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.674297  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 250 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  32.37 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 250 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2859  transcriptional regulator, TetR family  37.38 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.111234  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.78 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1674  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.997457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  27.1 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1470  transcriptional regulator, TetR family  38.52 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.772741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 193 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 193 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 193 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1137  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6786  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 243 aa  53.1  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.83 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4249  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.399807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 240 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  37.27 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.23 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1000  regulatory protein, TetR  29.46 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.23 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 180 aa  52.4  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.23 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.23 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.23 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 219 aa  52  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 193 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 193 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4161  putative transcriptional regulator  33.62 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 193 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1158  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.68 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3290  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 175 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6034  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0121  regulatory protein, TetR  42.86 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.602969 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 291 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  40 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>