More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2290 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2290  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 208 aa  406  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0794358  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1914  transcriptional regulator, TetR family  43.96 
 
 		 205 aa  144  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  37.98 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  37.13 
 
 		 211 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 213 aa  95.1  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  36.68 
 
 		 218 aa  85.1  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1950  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663338  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22560  transcriptional regulator, tetR family  32.14 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0880115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2079  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.674297  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0039  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1470  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.772741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4596  regulatory protein TetR  32.95 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  27.75 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  27.75 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4968  transcriptional regulator, TetR family domain protein  28.41 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4996  transcriptional regulator  27.84 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  32.93 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  30.59 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3073  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 226 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 310 aa  52  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 307 aa  52  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  37.74 
 
 		 226 aa  51.6  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 203 aa  51.6  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 224 aa  51.6  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  27.55 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  22.75 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  45.1 
 
 		 260 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  44.44 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 424 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  26.06 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3426  putative transcriptional regulator  43.86 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 280 aa  48.5  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3641  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 209 aa  48.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2241  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 198 aa  48.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7288  hitchhiker  0.000000000000408452 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  31.73 
 
 		 186 aa  48.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 233 aa  48.1  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 238 aa  48.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>