More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0439 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 180 aa  357  7e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  50.85 
 
 		 179 aa  161  5.0000000000000005e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  56.58 
 
 		 195 aa  160  9e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  48.88 
 
 		 183 aa  156  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 181 aa  147  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  47.09 
 
 		 178 aa  136  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  48.1 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 188 aa  104  8e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 186 aa  94.7  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37450  transcriptional regulator  44.36 
 
 		 177 aa  92  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0726232  normal  0.587989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  37.67 
 
 		 168 aa  72  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 168 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 175 aa  62  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  47.27 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  53.57 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  56.36 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  56.36 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  32 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 415 aa  55.1  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 428 aa  54.7  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 223 aa  54.3  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  54 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  52.83 
 
 		 219 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 189 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  47.27 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 206 aa  52.4  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0778  TetR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 260 aa  52  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2710  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.466457  normal  0.498996 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 186 aa  52  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 227 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 221 aa  52  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 244 aa  52  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 185 aa  51.6  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 227 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 219 aa  51.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0124  transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 		 298 aa  51.6  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 190 aa  51.6  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 194 aa  51.2  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 211 aa  51.2  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 208 aa  51.2  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  28.82 
 
 		 230 aa  50.8  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 192 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 357 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  31.71 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  36.89 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0069  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 219 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  32.72 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 215 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2026  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 218 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.148832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  41.07 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3347  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.084846  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3445  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>