More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2104 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  387  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  53.01 
 
 		 183 aa  204  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  47.57 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 222 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  43.89 
 
 		 185 aa  134  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  35.81 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  42.72 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  60 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  50 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  31.34 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.67 
 
 		 217 aa  64.3  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.67 
 
 		 217 aa  64.3  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.67 
 
 		 217 aa  64.3  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.67 
 
 		 217 aa  64.3  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  43.1 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.67 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5380  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768843  normal  0.61228 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  50 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  48.08 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  50 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2734  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2746  regulatory protein TetR  38.57 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3240  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  52.83 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.26 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1960  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  27.59 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  57.8  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 238 aa  57.8  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 246 aa  57.8  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 233 aa  57.8  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2292  intercellular adhesion regulator  41.38 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0364892  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 239 aa  57  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  43.64 
 
 		 265 aa  57  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2057  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  25.56 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>