More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1613 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  380  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 191 aa  145  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  40.57 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3798  TetR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 191 aa  121  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164802  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3794  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.549336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3867  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  45.11 
 
 		 201 aa  111  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4249  TetR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 191 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.399807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 291 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 192 aa  95.1  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 174 aa  91.3  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 198 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 255 aa  81.3  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  35.09 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1170  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 213 aa  71.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3664  regulatory protein, TetR  31.03 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 291 aa  61.2  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  28.89 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3705  regulatory protein TetR  30.21 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 286 aa  58.2  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03122  DNA-binding transcriptional regulator  28.9 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0442  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.671353  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3647  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  28.9 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0126984  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4581  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  28.9 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00305215  normal  0.159786 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03073  hypothetical protein  28.9 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.807649  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3749  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  28.9 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000431628  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0442  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  28.9 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3457  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  28.9 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315342  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  51.06 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  28.33 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3559  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  28.32 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00735263  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.01 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.01 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  36.14 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03670  transcriptional regulator  49.21 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00912022  hitchhiker  0.0085588 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 310 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 290 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 257 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.26 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3952  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 291 aa  53.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0756  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0490671  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 290 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 291 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.57 
 
 		 232 aa  52.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 290 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>