More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3004 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 186 aa  354  3.9999999999999996e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  40.33 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  44.17 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  42.28 
 
 		 185 aa  98.2  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  37.58 
 
 		 213 aa  85.5  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  45.26 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  37.59 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 255 aa  68.2  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  40.78 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  34.83 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  24.2 
 
 		 310 aa  62  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  44.62 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 181 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  25.73 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  22.73 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 202 aa  54.3  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2950  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  41.1 
 
 		 287 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3703  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1614  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0287431  hitchhiker  0.0000000422838 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3014  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.44 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.44 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  35.38 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4067  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200915  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3248  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 228 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.44 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.44 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.44 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 202 aa  52.4  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>