More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2654 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  99.51 
 
 		 207 aa  401  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0220  regulatory protein, TetR  29.19 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  45.31 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  29.27 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1169  regulatory protein, TetR  28.29 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1997  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0474929  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1589  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  26.04 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  34.26 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0417  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.582738  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2059  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 307 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  23.23 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  38.55 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0219  regulatory protein, TetR  26.77 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0391  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.914065  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 289 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  40.79 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 310 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2906  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0722139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 286 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 258 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 325 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2181  regulatory protein TetR  32.74 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 423 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1835  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 125 aa  52.4  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 231 aa  52.4  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4596  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 421 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.227831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0904  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0824382  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 414 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 180 aa  52  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 197 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>