More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6913 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 183 aa  356  9e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3664  regulatory protein, TetR  47.37 
 
 		 182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 201 aa  70.9  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 291 aa  65.5  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  31.21 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3794  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.549336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3867  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3798  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164802  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 238 aa  62  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 217 aa  62  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  54.39 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  55.74 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  51.06 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0994  transcriptional regulator, TetR family  55 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.885114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  31.33 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3730  transcriptional regulator, TetR family  60.78 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 332 aa  58.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2746  regulatory protein TetR  25.55 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  38.95 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  62.71 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  56 
 
 		 238 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  54.9 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 255 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3103  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.454868  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  52 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  50 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  56 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2579  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5380  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768843  normal  0.61228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3531  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0006  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0589242  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3117  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100627  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1978  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0013  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3781  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3842  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2859  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.111234  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 241 aa  54.7  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0804  transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 		 227 aa  54.3  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 226 aa  53.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  50 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 222 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 243 aa  54.3  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 226 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 228 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0226  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312291  hitchhiker  0.00018932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>