More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4249 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4249  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  378  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.399807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3798  TetR family transcriptional regulator  67.58 
 
 		 191 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164802  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3794  TetR family transcriptional regulator  67.03 
 
 		 191 aa  218  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.549336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3867  TetR family transcriptional regulator  67.03 
 
 		 191 aa  218  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 217 aa  98.2  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  35.39 
 
 		 194 aa  97.1  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 201 aa  90.9  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  32.8 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 205 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 183 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.38 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.38 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.38 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.38 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.62 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  29.92 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 203 aa  57.8  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  38 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  47.17 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  38 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.77 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  36.17 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.8 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  45.61 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3664  regulatory protein, TetR  30.81 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4096  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428343  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  28.49 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 243 aa  52.8  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3248  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  31.68 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 223 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 223 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 213 aa  51.6  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 231 aa  52  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 216 aa  51.6  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 310 aa  51.2  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 219 aa  51.2  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 208 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 234 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 201 aa  51.2  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 222 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 228 aa  50.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1096  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  35.06 
 
 		 220 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>