More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2740 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  478  1e-134  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 219 aa  245  4e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 243 aa  206  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  36.45 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  29.85 
 
 		 199 aa  98.6  7e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 204 aa  91.7  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1567  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.246189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1502  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385487  normal  0.318035 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  25.6 
 
 		 252 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 197 aa  61.6  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  24.55 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1427  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.286714  hitchhiker  0.000126282 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 206 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0300  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000186865  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1100  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3299  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000002111  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1705  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  24.62 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 193 aa  54.3  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1817  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 209 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 244 aa  52.4  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 240 aa  52.4  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 203 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  23.3 
 
 		 209 aa  52  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 214 aa  52  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  23.95 
 
 		 192 aa  52  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3334  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  48.94 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  21.39 
 
 		 770 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  21.55 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 269 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4249  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.399807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0293  TetR family transcriptional regulator  19.9 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000668888 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 182 aa  50.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  21.23 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08040  transcriptional regulator  24 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  21.23 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  21.23 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 406 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  19.89 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 205 aa  48.9  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 195 aa  48.9  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  24.42 
 
 		 196 aa  48.9  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 210 aa  48.9  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 208 aa  48.5  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 200 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 199 aa  48.5  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 200 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 200 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 194 aa  48.5  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  26.61 
 
 		 221 aa  48.5  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0881  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 197 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0875  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 197 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0892  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 197 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397174  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>