More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4193 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  400  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  85.93 
 
 		 234 aa  350  1e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  61.93 
 
 		 199 aa  259  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4321  TetR family transcriptional regulator  61.42 
 
 		 199 aa  240  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.675467  normal  0.0583361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3716  TetR family transcriptional regulator  60.2 
 
 		 199 aa  231  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3703  TetR family transcriptional regulator  60.2 
 
 		 199 aa  230  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3776  TetR family transcriptional regulator  60.2 
 
 		 199 aa  230  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 202 aa  214  8e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 202 aa  214  8e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 202 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 201 aa  202  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  51.04 
 
 		 201 aa  199  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  47.98 
 
 		 200 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  47.98 
 
 		 200 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 206 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 212 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  32.94 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  40 
 
 		 326 aa  68.6  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0397  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0669765  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2290  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 206 aa  62  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.721121  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  39.44 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  27.23 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  27.78 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1888  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  43.84 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1663  regulator AmrR  43.84 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211549  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2056  TetR family regulatory protein  43.84 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1902  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  43.84 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00105547  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0318  TetR family regulatory protein  43.84 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0868367  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0842  regulator AmrR  43.84 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.063166  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3213  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000469892  normal  0.140374 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  46.84 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8868  putative transcriptional regulator, TetR family  41 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2446  regulator AmrR  43.84 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584689  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4067  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200915  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2515  TetR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.745235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28320  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.115035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  44.16 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4679  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.136213 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3035  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.514093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22310  transcriptional regulator, tetR family  43.21 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>