More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3035 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3035  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 219 aa  428  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.514093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0397  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0669765  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  26.88 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  30.59 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  45.33 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 175 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2290  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.721121  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3703  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3776  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  45.95 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  29.88 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3716  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  24.6 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  24.6 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4321  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.675467  normal  0.0583361 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  24.6 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3794  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.549336  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  24.6 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  24.6 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3867  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  24.6 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3798  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164802  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  24.6 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  24.6 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  24.65 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  44.93 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  41.67 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4804  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2322  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.850071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0686  transcriptional regulator, TetR family  26.25 
 
 		 247 aa  54.3  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  43.64 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 326 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2004  regulatory protein TetR  45.45 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 257 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 254 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4830  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>