More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3716 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3716  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
199 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3703  TetR family transcriptional regulator  99.5 
 
 
199 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3776  TetR family transcriptional regulator  99.5 
 
 
199 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  91.46 
 
 
199 aa  370  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4321  TetR family transcriptional regulator  93.94 
 
 
199 aa  352  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.675467  normal  0.0583361 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  59.5 
 
 
234 aa  239  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  60.2 
 
 
200 aa  234  8e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  55.5 
 
 
201 aa  223  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  55.5 
 
 
201 aa  221  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  52.5 
 
 
202 aa  214  9e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  52.5 
 
 
202 aa  214  9e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  52.5 
 
 
202 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  49.5 
 
 
200 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  49.5 
 
 
200 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  49.5 
 
 
200 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 
204 aa  91.7  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  64.81 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0397  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0669765  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 
207 aa  63.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  35.71 
 
 
326 aa  62.8  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
216 aa  61.6  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 
239 aa  61.6  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
206 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  55.36 
 
 
205 aa  61.6  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
206 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  56.25 
 
 
206 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 
226 aa  60.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  34.46 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 
271 aa  60.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
214 aa  60.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  54.69 
 
 
208 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  43.28 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  44.3 
 
 
87 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 
234 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 
213 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 
234 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  53.97 
 
 
230 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  51.56 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2056  TetR family regulatory protein  45.31 
 
 
223 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  53.12 
 
 
219 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 
213 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 
219 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 
261 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
200 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  50 
 
 
221 aa  59.7  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 
213 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0842  regulator AmrR  45.31 
 
 
223 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.063166  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 
238 aa  59.3  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1663  regulator AmrR  45.31 
 
 
223 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211549  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 
213 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0318  TetR family regulatory protein  45.31 
 
 
223 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0868367  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1888  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  45.31 
 
 
223 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1902  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  45.31 
 
 
223 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00105547  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
212 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 
239 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 
242 aa  58.9  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
206 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
212 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 
205 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
212 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
206 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  46.97 
 
 
226 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  47.54 
 
 
201 aa  58.5  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  48.53 
 
 
221 aa  58.5  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 
222 aa  57.8  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  50.79 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  50.79 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 
194 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
197 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
224 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 
187 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  50.79 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  50.79 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  50.79 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  50.79 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  51.56 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 
216 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
217 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>