More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3354 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 210 aa  438  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0397  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0669765  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 204 aa  85.1  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  28.98 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3035  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.514093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  33.58 
 
 		 326 aa  67  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  28.89 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4804  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  52.83 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0686  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1179  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288888  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 175 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 250 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2290  TetR family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.721121  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03122  DNA-binding transcriptional regulator  47.17 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0442  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.671353  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03073  hypothetical protein  47.17 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.807649  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0298  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3457  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  47.17 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315342  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 307 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3749  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  47.17 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000431628  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0442  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  47.17 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3559  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  47.17 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00735263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4581  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  47.17 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00305215  normal  0.159786 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3647  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  47.17 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0126984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2703  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 291 aa  52  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 310 aa  51.6  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  35.82 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5358  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 305 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4608  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.198377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.62 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.62 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.62 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.62 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>