More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_15710 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  436  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0397  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0669765  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0686  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  35.81 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 182 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  28.93 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4572  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2384  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 497 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0652  Transcriptional regulator protein  47.37 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 305 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  45.9 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  45.61 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7278  Transcriptional regulator  45.76 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2290  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.721121  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  36.14 
 
 		 197 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 243 aa  53.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2902  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 187 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.465511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3516  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  41.82 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  41.82 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  41.82 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  41.82 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  41.82 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>