More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2384 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2384  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
187 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2902  TetR family transcriptional regulator  87.1 
 
 
187 aa  334  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.465511  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2810  TetR family transcriptional regulator  87.1 
 
 
187 aa  329  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2880  TetR family transcriptional regulator  85.48 
 
 
187 aa  325  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.924779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3906  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
189 aa  200  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0242743  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2626  TetR family transcriptional regulator  53.76 
 
 
188 aa  195  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6064  TetR family transcriptional regulator  48.63 
 
 
192 aa  181  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5358  transcriptional regulator, TetR family  46.96 
 
 
196 aa  171  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  47.16 
 
 
191 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1974  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
188 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36617  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1617  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1392  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.637203  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2118  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2503  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3196  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
293 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.431019  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2643  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
304 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2556  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
304 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28320  TetR family transcriptional regulator  42.7 
 
 
193 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.115035  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  34.76 
 
 
186 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1758  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
189 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3634  regulatory protein, TetR  30.37 
 
 
189 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.247606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2116  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 
218 aa  94.4  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3941  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 
222 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
188 aa  92  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3303  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
221 aa  91.3  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.808306 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4582  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
191 aa  90.9  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278118  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3096  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
213 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.631067  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0696  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 
194 aa  85.1  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4037  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
185 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0431559  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 
195 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3577  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
218 aa  82  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  37.9 
 
 
190 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
196 aa  82  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0068  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0084  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4385  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
190 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 
197 aa  77.8  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0741  regulatory protein, TetR  30.32 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6204  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2732  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1879  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 
179 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
228 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0195  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.5282  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0107  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267531  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0298  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
198 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4813  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800631  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2526  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5405  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8534  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1426  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620095 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5456  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
195 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.31437 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0652  Transcriptional regulator protein  34.48 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3184  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
186 aa  72  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
206 aa  72  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4587  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 
199 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358268  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0171  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3782  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.59056  normal  0.419733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3810  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2276  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3233  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
193 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1978  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 
179 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0203016  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4120  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3797  regulatory protein TetR  29.57 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.350305  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1509  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0671702  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23590  putative transcriptional regulator  31.84 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0142024 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3383  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1999  putative transcriptional regulator  31.84 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4799  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5341  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601109  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2172  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046251 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.403978 
 
 
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NC_010501  PputW619_1541  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.932149  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6000  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
180 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513273  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1188  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 
193 aa  67  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  26.59 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_0427  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012850  Rleg_1602  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0030  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100703  normal 
 
 
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NC_008782  Ajs_2168  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal 
 
 
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NC_013595  Sros_6374  putative transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.891873 
 
 
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NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_5143  transcriptional regulator  31.07 
 
 
200 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal  0.0526166 
 
 
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NC_010524  Lcho_3648  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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NC_011666  Msil_2973  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0965425 
 
 
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NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.67022 
 
 
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NC_010335  Caul_5097  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007908  Rfer_1766  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
196 aa  62.8  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390977  n/a   
 
 
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