More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6328 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 199 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4587  transcriptional regulator, TetR family  81.91 
 
 		 199 aa  340  8e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0652  Transcriptional regulator protein  67.01 
 
 		 196 aa  249  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0298  TetR family transcriptional regulator  60.62 
 
 		 198 aa  240  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2897  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 194 aa  166  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3383  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  36.87 
 
 		 186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1766  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390977  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3303  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 221 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.808306 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2973  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0965425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4582  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 191 aa  101  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3941  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3096  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.631067  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 201 aa  97.1  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0084  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 192 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 197 aa  94.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 192 aa  94.7  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2116  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1758  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 189 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3577  TetR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  90.5  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3634  regulatory protein, TetR  32.09 
 
 		 189 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.247606 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2526  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 252 aa  90.9  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3184  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4037  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 185 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0431559  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0696  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 194 aa  89.4  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5358  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 196 aa  88.6  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2626  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 188 aa  89  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 196 aa  88.6  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3233  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 192 aa  87.8  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8534  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  31.15 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1426  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 190 aa  85.9  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620095 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5097  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 199 aa  85.9  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2017  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 184 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.93886 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4322  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  85.1  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136212  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4385  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 201 aa  84.7  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1617  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2503  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1392  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.637203  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2118  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2556  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2643  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3196  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.431019  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1974  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36617  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1188  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6064  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2276  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0107  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267531  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1602  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28320  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.115035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2880  TetR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.924779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2480  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 198 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6204  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5143  transcriptional regulator  30.51 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal  0.0526166 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67022 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0068  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2810  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4120  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  29 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0427  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2384  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0171  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3797  regulatory protein TetR  30.3 
 
 		 180 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.350305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3906  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0242743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2902  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.465511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3810  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2719  regulatory protein, TetR  30.4 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111608  normal  0.97579 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2933  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0101224  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2172  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046251 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0195  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.5282  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0741  regulatory protein, TetR  29.47 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2168  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_4903  putative TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021531  normal  0.0222673 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2441  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.509096 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010510  Mrad2831_6000  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513273  normal  1 
 
 
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NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 198 aa  67.8  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
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NC_008391  Bamb_4737  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 209 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.838213 
 
 
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NC_012880  Dd703_1453  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
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NC_011071  Smal_2005  transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.848045  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0030  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100703  normal  1 
 
 
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NC_010524  Lcho_3648  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_5341  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601109  normal  1 
 
 
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NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
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