228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2897 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2897  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  397  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4587  transcriptional regulator, TetR family  45.13 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0298  TetR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 198 aa  164  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3383  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 197 aa  143  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0652  Transcriptional regulator protein  47.14 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1766  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 196 aa  99  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390977  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2973  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 211 aa  92.8  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0965425 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5358  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 196 aa  87.8  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  34.64 
 
 		 191 aa  86.3  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6064  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 192 aa  85.5  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 192 aa  85.1  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 195 aa  84.3  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3233  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2626  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3906  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0242743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3577  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1426  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620095 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4037  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0431559  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1602  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0696  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1758  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2526  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3096  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.631067  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3634  regulatory protein, TetR  28.19 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.247606 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3303  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.808306 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  28.71 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3941  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0084  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4120  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3797  regulatory protein TetR  30.56 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.350305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2017  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.93886 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6000  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0068  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4582  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67022 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2933  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0101224  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2719  regulatory protein, TetR  33.91 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111608  normal  0.97579 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3608  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 198 aa  62  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6204  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2902  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.465511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4322  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136212  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2384  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2810  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1188  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0171  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2116  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28320  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.115035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8534  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1617  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2910  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2118  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2503  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1392  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.637203  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2880  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.924779 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3196  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 293 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.431019  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2643  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 304 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1974  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36617  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2556  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 304 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2276  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5143  transcriptional regulator  27.33 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal  0.0526166 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4385  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3184  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0427  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 180 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  25.37 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0741  regulatory protein, TetR  29.76 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0539  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0195  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.5282  normal  0.427112 
 
 
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NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_2480  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
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NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
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NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  39.71 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
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NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
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NC_007948  Bpro_0107  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267531  normal  0.797255 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3810  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011663  Sbal223_2172  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046251 
 
 
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NC_010335  Caul_5097  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_2168  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 188 aa  52.8  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_0020  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 246 aa  50.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.390674  normal  0.0209926 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
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NC_010552  BamMC406_5341  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601109  normal  1 
 
 
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