More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2480 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2480  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
198 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2933  transcriptional regulator, TetR family  65.78 
 
 
193 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0101224  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3648  TetR family transcriptional regulator  62.23 
 
 
204 aa  242  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  63.24 
 
 
191 aa  240  9e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4737  TetR family transcriptional regulator  63.1 
 
 
209 aa  239  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.838213 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2017  TetR family transcriptional regulator  59.89 
 
 
184 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.93886 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2719  regulatory protein, TetR  63.64 
 
 
193 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111608  normal  0.97579 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2172  transcriptional regulator, TetR family  59.57 
 
 
185 aa  232  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046251 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2168  TetR family transcriptional regulator  61.38 
 
 
188 aa  227  9e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3184  TetR family transcriptional regulator  57.45 
 
 
186 aa  213  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2276  TetR family transcriptional regulator  55.98 
 
 
182 aa  211  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2005  transcriptional regulator, TetR family  59.36 
 
 
193 aa  205  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.848045  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  54.4 
 
 
197 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5272  TetR family transcriptional regulator  56.95 
 
 
173 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.118742  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  41.88 
 
 
192 aa  138  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 
200 aa  133  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.67022 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8534  transcriptional regulator, TetR family  44.57 
 
 
201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5143  transcriptional regulator  39.79 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal  0.0526166 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0427  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 
180 aa  125  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  41.71 
 
 
193 aa  124  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  38.97 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4120  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 
180 aa  119  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0084  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
205 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 
192 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
196 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0195  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
194 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.5282  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3797  regulatory protein TetR  39.13 
 
 
180 aa  118  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.350305  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3608  TetR family transcriptional regulator  41.12 
 
 
198 aa  117  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6000  TetR family transcriptional regulator  39.67 
 
 
180 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513273  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 
193 aa  116  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1188  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 
193 aa  115  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4813  TetR family transcriptional regulator  40.33 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800631  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2441  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.509096 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5341  TetR family transcriptional regulator  41.44 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601109  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5405  TetR family transcriptional regulator  40.88 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4799  TetR family transcriptional regulator  41.44 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0539  TetR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  39.04 
 
 
203 aa  112  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5456  TetR family transcriptional regulator  40.88 
 
 
195 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.31437 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2116  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
218 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3941  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 
222 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  38.5 
 
 
194 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3096  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.631067  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3303  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
221 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.808306 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1426  transcriptional regulator, TetR family  37.77 
 
 
190 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620095 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4322  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
198 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136212  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4903  putative TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
200 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021531  normal  0.0222673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6374  putative transcriptional regulator, TetR family  41.36 
 
 
191 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3233  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
193 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
199 aa  101  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4962  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 
196 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0320648  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2973  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
211 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0965425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3577  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
218 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2699  transcriptional regulator, TetR family  39.38 
 
 
197 aa  99.8  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1602  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 
191 aa  98.6  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1766  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
196 aa  97.8  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390977  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6204  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 
199 aa  97.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
228 aa  96.7  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2526  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
252 aa  96.3  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
206 aa  95.9  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 
204 aa  94.7  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
190 aa  94  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4385  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
201 aa  94.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0741  regulatory protein, TetR  36.22 
 
 
211 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0107  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
199 aa  93.2  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267531  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5097  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 
199 aa  92.8  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 
199 aa  91.3  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  33.84 
 
 
186 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5110  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
205 aa  88.6  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0068  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
193 aa  87.8  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  33.33 
 
 
186 aa  87.8  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 
190 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2995  TetR family transcriptional regulator  40.97 
 
 
205 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
195 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4582  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278118  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4037  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0431559  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
188 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1758  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0171  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4681  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3810  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
190 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3634  regulatory protein, TetR  30.48 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.247606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4587  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358268  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28320  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.115035  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1221  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.342861 
 
 
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NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008009  Acid345_0696  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007336  Reut_C6064  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_2732  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.748169 
 
 
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NC_008463  PA14_23590  putative transcriptional regulator  32.6 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0142024 
 
 
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NC_003910  CPS_3383  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_1879  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1999  putative transcriptional regulator  32.04 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012792  Vapar_5358  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 
196 aa  65.1  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_1509  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
179 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0671702  normal 
 
 
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NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  26.67 
 
 
191 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_1541  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
179 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.932149  normal  0.0804871 
 
 
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