More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4347 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 190 aa  384  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  62.11 
 
 		 190 aa  242  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 188 aa  121  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1602  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 191 aa  117  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1426  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620095 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4582  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 191 aa  114  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 199 aa  113  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2116  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 218 aa  111  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0741  regulatory protein, TetR  32.98 
 
 		 211 aa  111  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3096  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.631067  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 228 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  35.11 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0107  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 199 aa  108  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267531  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3303  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.808306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3577  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4385  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  108  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2526  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3634  regulatory protein, TetR  33.16 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.247606 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0084  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1766  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390977  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 195 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 200 aa  105  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6374  putative transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 191 aa  104  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6204  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 199 aa  104  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4037  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 185 aa  104  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0431559  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1758  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2973  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0965425 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3941  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 222 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8534  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 190 aa  101  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0195  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.5282  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4813  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 195 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5405  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 195 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2441  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 193 aa  99.4  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.509096 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 193 aa  99.4  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5456  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 195 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.31437 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3233  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 193 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 195 aa  96.3  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0696  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 194 aa  94.7  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4799  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 195 aa  94.7  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5341  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 194 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 194 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3648  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5097  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 199 aa  91.3  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0427  transcriptional regulator, TetR family  33.69 
 
 		 180 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  32.24 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3184  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4322  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 198 aa  89.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136212  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4903  putative TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 200 aa  89.4  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021531  normal  0.0222673 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 193 aa  89  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4737  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 209 aa  88.6  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.838213 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2933  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 193 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0101224  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2276  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 182 aa  88.6  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2017  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 184 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.93886 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2172  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 185 aa  88.2  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046251 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 191 aa  88.2  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2480  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 198 aa  87  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2719  regulatory protein, TetR  35.11 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111608  normal  0.97579 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2168  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6000  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 180 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513273  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2880  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 187 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.924779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4962  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 196 aa  84.7  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0320648  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0030  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 196 aa  84.3  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2810  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4120  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3797  regulatory protein TetR  30.77 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.350305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2902  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.465511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1188  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2384  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3608  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2995  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5143  transcriptional regulator  29.71 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal  0.0526166 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1221  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342861 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0539  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0171  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2699  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0068  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1617  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1392  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.637203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2503  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2118  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1879  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3810  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3196  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 293 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.431019  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2556  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 304 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6064  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2643  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 304 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5110  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3383  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1893  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>