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for query gene Rmet_3608 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_3608  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
198 aa  400  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4903  putative TetR family transcriptional regulator  54.64 
 
 
200 aa  205  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021531  normal  0.0222673 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4322  TetR family transcriptional regulator  52.33 
 
 
198 aa  191  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136212  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  51.04 
 
 
193 aa  191  8e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1188  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
193 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0427  transcriptional regulator, TetR family  43.01 
 
 
180 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  42.33 
 
 
192 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 
192 aa  147  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6374  putative transcriptional regulator, TetR family  47.15 
 
 
191 aa  145  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  44.06 
 
 
200 aa  141  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.67022 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  41.4 
 
 
192 aa  137  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3941  transcriptional regulator, TetR family  43.01 
 
 
222 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2441  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 
193 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.509096 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 
193 aa  136  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3096  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
213 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.631067  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6000  TetR family transcriptional regulator  43.09 
 
 
180 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513273  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4962  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 
196 aa  132  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0320648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2699  transcriptional regulator, TetR family  42.35 
 
 
197 aa  131  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2168  TetR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
188 aa  130  9e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2017  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
184 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.93886 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 
191 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2480  TetR family transcriptional regulator  41.62 
 
 
198 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2116  TetR family transcriptional regulator  38.66 
 
 
218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3303  TetR family transcriptional regulator  38.22 
 
 
221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.808306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3577  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4737  TetR family transcriptional regulator  40.89 
 
 
209 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.838213 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0084  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3184  TetR family transcriptional regulator  40.2 
 
 
186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5143  transcriptional regulator  39.89 
 
 
200 aa  125  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal  0.0526166 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8534  transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 
201 aa  123  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4120  transcriptional regulator, TetR family  38.74 
 
 
180 aa  123  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2719  regulatory protein, TetR  42.21 
 
 
193 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111608  normal  0.97579 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3797  regulatory protein TetR  39.36 
 
 
180 aa  122  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.350305  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 
203 aa  121  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2276  TetR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
182 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2933  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 
193 aa  118  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0101224  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3648  TetR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
204 aa  118  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2172  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046251 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1602  transcriptional regulator, TetR family  38.62 
 
 
191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0741  regulatory protein, TetR  39.23 
 
 
211 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1426  transcriptional regulator, TetR family  38.22 
 
 
190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620095 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  38.62 
 
 
194 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  36.98 
 
 
197 aa  111  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2005  transcriptional regulator, TetR family  41.95 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.848045  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0195  TetR family transcriptional regulator  38.66 
 
 
194 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.5282  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3233  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
193 aa  104  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  40.41 
 
 
206 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2973  transcriptional regulator, TetR family  36.6 
 
 
211 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0965425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 
186 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  39.27 
 
 
196 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
199 aa  100  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0539  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 
201 aa  99.4  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1766  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
196 aa  99.4  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390977  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4799  TetR family transcriptional regulator  38.62 
 
 
195 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5341  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
194 aa  99  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601109  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 
190 aa  97.8  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 
199 aa  97.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1221  transcriptional regulator, TetR family  39.2 
 
 
186 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.342861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4385  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
201 aa  95.9  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5110  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
190 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5405  TetR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
195 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0107  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
199 aa  92.8  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267531  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2526  TetR family transcriptional regulator  36.55 
 
 
252 aa  92.8  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5456  TetR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
195 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.31437 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
204 aa  92  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4813  TetR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
195 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800631  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4681  TetR family transcriptional regulator  34.66 
 
 
204 aa  91.7  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6204  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 
199 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5097  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 
199 aa  89.4  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0696  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
194 aa  89  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4582  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
191 aa  88.2  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278118  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4037  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
185 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0431559  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 
228 aa  85.5  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
188 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5272  TetR family transcriptional regulator  38.69 
 
 
173 aa  85.1  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.118742  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1758  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 
189 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 
195 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5358  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 
195 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0171  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
189 aa  79  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3634  regulatory protein, TetR  30.73 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.247606 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0030  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
196 aa  78.2  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100703  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0068  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  31.02 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1879  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0298  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
198 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_23590  putative transcriptional regulator  34.41 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0142024 
 
 
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NC_010511  M446_2995  TetR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0523811 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1999  putative transcriptional regulator  34.41 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  30.69 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal 
 
 
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NC_007336  Reut_C6064  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0524247 
 
 
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NC_003910  CPS_3383  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_2732  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.748169 
 
 
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