More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1221 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1221  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 186 aa  367  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342861 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4681  TetR family transcriptional regulator  50.84 
 
 		 204 aa  161  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 192 aa  111  8.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  38.25 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0427  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4322  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 198 aa  104  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136212  n/a   
 
 
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NC_007973  Rmet_3608  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1188  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 193 aa  101  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  38.07 
 
 		 191 aa  99.8  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0084  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 205 aa  99.4  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6000  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 180 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4903  putative TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 200 aa  97.8  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021531  normal  0.0222673 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8534  transcriptional regulator, TetR family  35.39 
 
 		 201 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4120  transcriptional regulator, TetR family  38.92 
 
 		 180 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3797  regulatory protein TetR  38.92 
 
 		 180 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.350305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1426  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 190 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620095 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 190 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4962  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 196 aa  92  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0320648  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2719  regulatory protein, TetR  40.45 
 
 		 193 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111608  normal  0.97579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6374  putative transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1602  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 190 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 203 aa  89  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0195  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 194 aa  89  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.5282  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 200 aa  88.6  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67022 
 
 
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NC_011071  Smal_2005  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 193 aa  88.6  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.848045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2116  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 218 aa  87.8  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.332215 
 
 
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NC_007925  RPC_3096  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 213 aa  88.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.631067  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3184  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 186 aa  87.8  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2172  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046251 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3303  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 221 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.808306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5143  transcriptional regulator  36.47 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal  0.0526166 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2276  TetR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2526  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 252 aa  86.3  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2480  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 198 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3648  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  85.5  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_3941  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 222 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2441  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 193 aa  85.5  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.509096 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2933  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 193 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0101224  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0539  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 201 aa  84.7  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2017  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 184 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.93886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5341  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 194 aa  84.3  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601109  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_2168  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 188 aa  84.3  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008391  Bamb_4799  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  34.68 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4737  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.838213 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2973  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0965425 
 
 
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NC_008061  Bcen_5405  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 195 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4813  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 195 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5456  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.31437 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4582  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278118  normal  1 
 
 
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NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
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NC_010335  Caul_5097  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 195 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3577  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  77.8  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3233  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0741  regulatory protein, TetR  34.64 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2995  TetR family transcriptional regulator  66.07 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0696  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4037  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0431559  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5110  TetR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1766  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390977  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1758  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3634  regulatory protein, TetR  32.58 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.247606 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4385  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 201 aa  64.3  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2699  transcriptional regulator, TetR family  49.25 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0030  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6204  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0107  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267531  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3383  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  31.74 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 228 aa  57.8  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
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NC_012858  Rleg_6699  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.678516  normal  0.427356 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 199 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
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NC_009439  Pmen_2732  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.748169 
 
 
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NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3810  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010335  Caul_5107  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346129  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
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NC_011366  Rleg2_5796  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0048122 
 
 
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NC_007963  Csal_2910  TetR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
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NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  45.68 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
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