More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3303 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_3303  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
221 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.808306 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2116  TetR family transcriptional regulator  82.21 
 
 
218 aa  347  9e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3941  transcriptional regulator, TetR family  80.21 
 
 
222 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3096  TetR family transcriptional regulator  74.76 
 
 
213 aa  317  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.631067  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3577  TetR family transcriptional regulator  65.9 
 
 
218 aa  278  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2973  transcriptional regulator, TetR family  41.58 
 
 
211 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0965425 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1426  transcriptional regulator, TetR family  45.55 
 
 
190 aa  138  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620095 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1602  transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 
191 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1766  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 
196 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390977  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  39.57 
 
 
199 aa  131  7.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0741  regulatory protein, TetR  42.08 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  39.64 
 
 
228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4903  putative TetR family transcriptional regulator  42.7 
 
 
200 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021531  normal  0.0222673 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  39.64 
 
 
192 aa  124  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2276  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
182 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6204  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 
199 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4385  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 
201 aa  121  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  38.34 
 
 
191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3184  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 
192 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0107  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
199 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267531  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1188  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  35.61 
 
 
197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 
188 aa  115  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  38.34 
 
 
193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
195 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2441  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 
193 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.509096 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 
190 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3608  TetR family transcriptional regulator  38.22 
 
 
198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 
199 aa  112  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
200 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.67022 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3233  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
193 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2017  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
184 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.93886 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0427  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 
180 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 
186 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0696  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
194 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2526  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
252 aa  110  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2172  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 
185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046251 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4582  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278118  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4322  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136212  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 
190 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2933  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 
193 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0101224  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1879  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
179 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2480  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
198 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1758  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 
189 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6374  putative transcriptional regulator, TetR family  38.31 
 
 
191 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4037  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 
185 aa  105  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0431559  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0084  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
205 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
199 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3634  regulatory protein, TetR  34.21 
 
 
189 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.247606 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1999  putative transcriptional regulator  38.8 
 
 
180 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8534  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 
201 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23590  putative transcriptional regulator  38.25 
 
 
180 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0142024 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0195  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 
194 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.5282  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4962  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 
196 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0320648  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5143  transcriptional regulator  38.1 
 
 
200 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal  0.0526166 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4587  transcriptional regulator, TetR family  34.17 
 
 
199 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358268  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2719  regulatory protein, TetR  35.64 
 
 
193 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111608  normal  0.97579 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
190 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 
206 aa  99.4  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3648  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
204 aa  99.4  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4737  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
209 aa  99  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.838213 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6000  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
180 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513273  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1541  TetR family transcriptional regulator  38.5 
 
 
179 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.932149  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2732  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 
179 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4120  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 
180 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2626  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 
188 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2168  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
188 aa  94.4  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3797  regulatory protein TetR  32.11 
 
 
180 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.350305  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
196 aa  92  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5358  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
196 aa  91.3  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2384  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
187 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3906  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 
189 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0242743  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0539  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
201 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1978  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
179 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0203016  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3782  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
179 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.59056  normal  0.419733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1509  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
179 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0671702  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  32.43 
 
 
191 aa  89.4  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
194 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4813  TetR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
195 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800631  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0298  TetR family transcriptional regulator  32.55 
 
 
198 aa  88.2  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2005  transcriptional regulator, TetR family  38.93 
 
 
193 aa  88.2  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.848045  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5405  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 
195 aa  88.2  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2810  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 
187 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4799  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
195 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.914161 
 
 
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NC_010322  PputGB1_2902  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 
187 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.465511  normal 
 
 
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NC_010552  BamMC406_5341  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
194 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601109  normal 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5456  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 
195 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.31437 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2880  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 
187 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.924779 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0068  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
193 aa  85.1  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_003910  CPS_3383  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
197 aa  84  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal 
 
 
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NC_007336  Reut_C6064  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
192 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_2556  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A3196  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
293 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.431019  n/a   
 
 
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