More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4813 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4813  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
195 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800631  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5405  TetR family transcriptional regulator  98.97 
 
 
195 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5456  TetR family transcriptional regulator  98.46 
 
 
195 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.31437 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5341  TetR family transcriptional regulator  87.18 
 
 
194 aa  321  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601109  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4799  TetR family transcriptional regulator  87.18 
 
 
195 aa  320  7e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0195  TetR family transcriptional regulator  82.29 
 
 
194 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.5282  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  41.88 
 
 
192 aa  136  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  43.81 
 
 
200 aa  133  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.67022 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0084  TetR family transcriptional regulator  40.93 
 
 
205 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2276  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
182 aa  125  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3184  TetR family transcriptional regulator  40.64 
 
 
186 aa  123  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  39.8 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 
197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2017  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
184 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.93886 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2480  TetR family transcriptional regulator  40.33 
 
 
198 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
194 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 
191 aa  119  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4737  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
209 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.838213 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2172  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 
185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046251 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2168  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1188  transcriptional regulator, TetR family  38.34 
 
 
193 aa  115  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 
193 aa  115  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2441  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 
193 aa  115  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.509096 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3648  TetR family transcriptional regulator  39.79 
 
 
204 aa  115  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8534  transcriptional regulator, TetR family  40.1 
 
 
201 aa  115  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5143  transcriptional regulator  34.55 
 
 
200 aa  111  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal  0.0526166 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2719  regulatory protein, TetR  37.43 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111608  normal  0.97579 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5110  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
205 aa  108  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0427  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 
180 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2933  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 
193 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0101224  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4322  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
198 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136212  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0539  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
201 aa  105  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 
190 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2526  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
252 aa  105  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  37.19 
 
 
192 aa  104  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0741  regulatory protein, TetR  37.37 
 
 
211 aa  104  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
192 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 
188 aa  101  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2116  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
218 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  41.58 
 
 
196 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6374  putative transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 
191 aa  99.8  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  38.98 
 
 
186 aa  99.8  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0107  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
199 aa  99.4  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267531  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
203 aa  98.6  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2005  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 
193 aa  98.6  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.848045  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
199 aa  98.6  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  40.96 
 
 
186 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 
199 aa  97.8  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3303  TetR family transcriptional regulator  36.1 
 
 
221 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.808306 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
204 aa  95.9  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5097  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
199 aa  95.1  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6204  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 
199 aa  95.1  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
228 aa  95.1  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4903  putative TetR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
200 aa  95.1  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021531  normal  0.0222673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3941  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 
222 aa  95.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1426  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 
190 aa  95.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620095 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 
190 aa  94.7  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4385  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
201 aa  94.4  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1766  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
196 aa  92.4  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390977  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3096  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
213 aa  92  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.631067  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 
195 aa  91.3  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5272  TetR family transcriptional regulator  38.93 
 
 
173 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.118742  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2699  transcriptional regulator, TetR family  38.86 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4962  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 
196 aa  88.2  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0320648  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3233  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
193 aa  87  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4037  TetR family transcriptional regulator  33.84 
 
 
185 aa  87  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0431559  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1602  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
191 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
201 aa  85.9  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2973  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 
211 aa  85.9  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0965425 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3608  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
198 aa  85.9  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3577  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
218 aa  85.9  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
195 aa  85.5  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6000  TetR family transcriptional regulator  38.5 
 
 
180 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513273  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4120  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 
180 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1758  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 
189 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3797  regulatory protein TetR  36.9 
 
 
180 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.350305  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3634  regulatory protein, TetR  34.04 
 
 
189 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.247606 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5358  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 
196 aa  82  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1879  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2732  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0171  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 
190 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4582  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278118  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1999  putative transcriptional regulator  33.87 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2384  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23590  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0142024 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2902  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
187 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.465511  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0030  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100703  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1509  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
179 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0671702  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2810  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3782  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.59056  normal  0.419733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1978  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
179 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0203016  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  31.58 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0696  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2880  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.924779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1221  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.342861 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4681  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 
199 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1541  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
179 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.932149  normal  0.0804871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>