More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0068 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0068  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
193 aa  401  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3810  TetR family transcriptional regulator  73.06 
 
 
191 aa  296  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  36.61 
 
 
186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0171  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
189 aa  115  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
186 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0030  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 
196 aa  95.1  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100703  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 
201 aa  93.2  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2017  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 
184 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.93886 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 
191 aa  92.8  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3648  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
204 aa  89.4  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4737  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
209 aa  89  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.838213 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
192 aa  89  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2168  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
188 aa  88.6  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2480  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
198 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3303  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
221 aa  85.1  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.808306 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
190 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2810  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0084  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2880  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.924779 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3184  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8534  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 
201 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2526  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
252 aa  82  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4582  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 
191 aa  82  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278118  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2172  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 
185 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046251 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
188 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2116  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
218 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3941  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 
222 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2384  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2276  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4322  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
198 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136212  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 
197 aa  79  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0298  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 
198 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 
199 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2719  regulatory protein, TetR  29 
 
 
193 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111608  normal  0.97579 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  29.63 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 
195 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2933  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0101224  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.67022 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4587  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358268  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2902  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.465511  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3906  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0242743  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1426  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5143  transcriptional regulator  28.26 
 
 
200 aa  74.7  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal  0.0526166 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1602  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 
191 aa  74.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
194 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4037  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0431559  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6064  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2626  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5097  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2973  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0965425 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3233  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3096  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.631067  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2005  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 
193 aa  72  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.848045  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 
193 aa  72  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1879  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1541  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.932149  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0427  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5358  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 
196 aa  71.2  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2441  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
193 aa  71.2  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.509096 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1188  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1509  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0671702  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2910  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3782  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.59056  normal  0.419733 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0741  regulatory protein, TetR  27.96 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1766  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390977  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3577  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3608  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23590  putative transcriptional regulator  29.44 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0142024 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1978  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0203016  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
199 aa  67.8  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1999  putative transcriptional regulator  29.28 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4120  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 
180 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0195  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.5282  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6374  putative transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3797  regulatory protein TetR  28.34 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.350305  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6204  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6000  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513273  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1758  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_3634  regulatory protein, TetR  26.23 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.247606 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4385  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007948  Bpro_0107  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 
199 aa  64.3  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267531  normal  0.797255 
 
 
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NC_007974  Rmet_4903  putative TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021531  normal  0.0222673 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_2897  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 
194 aa  63.2  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008688  Pden_4681  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal 
 
 
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NC_008463  PA14_28320  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
193 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.115035  normal 
 
 
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NC_011989  Avi_0652  Transcriptional regulator protein  30.22 
 
 
196 aa  62.4  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
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NC_009439  Pmen_2732  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.748169 
 
 
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