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for query gene PSPTO_1758 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1758  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
189 aa  387  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3634  regulatory protein, TetR  86.24 
 
 
189 aa  339  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.247606 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4037  TetR family transcriptional regulator  59.34 
 
 
185 aa  218  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0431559  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  57.75 
 
 
188 aa  209  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  53.76 
 
 
186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  57.3 
 
 
190 aa  184  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3096  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.631067  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3941  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 
222 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3303  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
221 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.808306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3577  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
218 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2973  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 
211 aa  106  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0965425 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1766  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
196 aa  106  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390977  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4582  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
191 aa  106  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278118  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 
190 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2116  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
218 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2880  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
187 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.924779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2902  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
187 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.465511  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2810  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
187 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2526  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 
252 aa  100  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1426  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 
190 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620095 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0741  regulatory protein, TetR  35.33 
 
 
211 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0298  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
198 aa  97.8  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2172  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 
185 aa  97.8  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046251 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
190 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2626  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
188 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2384  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
187 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
204 aa  96.7  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4587  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 
199 aa  94.4  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358268  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1602  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 
191 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  33.69 
 
 
191 aa  94  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 
192 aa  94  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 
197 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 
199 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3906  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
189 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0242743  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
203 aa  91.3  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0084  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
205 aa  88.6  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6374  putative transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 
191 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4962  transcriptional regulator, TetR family  34.24 
 
 
196 aa  85.9  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0320648  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5143  transcriptional regulator  29.35 
 
 
200 aa  85.5  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal  0.0526166 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
194 aa  85.5  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 
192 aa  85.5  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1879  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 
179 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0195  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
194 aa  84.3  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.5282  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8534  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 
201 aa  84.3  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3184  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
199 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3233  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2168  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3383  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4813  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800631  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0539  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5405  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2017  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
184 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.93886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5341  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
194 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601109  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  29.53 
 
 
191 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5456  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.31437 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4737  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.838213 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4799  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 
195 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6064  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2480  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2276  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1617  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2503  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1509  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0671702  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1392  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.637203  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2118  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3196  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.431019  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.67022 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0652  Transcriptional regulator protein  31.28 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2643  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
304 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2556  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
304 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1541  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.932149  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5358  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 
196 aa  77.8  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1999  putative transcriptional regulator  32.77 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1974  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36617  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0696  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
194 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3782  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.59056  normal  0.419733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23590  putative transcriptional regulator  32.77 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0142024 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1978  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
179 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0203016  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1188  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 
193 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_0171  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
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NC_010002  Daci_4385  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007974  Rmet_4903  putative TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021531  normal  0.0222673 
 
 
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NC_008782  Ajs_2441  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.509096 
 
 
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NC_012792  Vapar_6204  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_4120  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010172  Mext_3797  regulatory protein TetR  30.81 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.350305  normal 
 
 
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NC_004578  PSPTO_2933  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0101224  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_3648  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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NC_007973  Rmet_3608  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008463  PA14_28320  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
193 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.115035  normal 
 
 
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NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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