More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2933 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2933  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
193 aa  394  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0101224  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2719  regulatory protein, TetR  82.29 
 
 
193 aa  314  5e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111608  normal  0.97579 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4737  TetR family transcriptional regulator  67.91 
 
 
209 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.838213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2480  TetR family transcriptional regulator  65.78 
 
 
198 aa  249  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2017  TetR family transcriptional regulator  63.64 
 
 
184 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.93886 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3648  TetR family transcriptional regulator  62.18 
 
 
204 aa  245  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  65.03 
 
 
191 aa  244  4e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2168  TetR family transcriptional regulator  65.08 
 
 
188 aa  239  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2276  TetR family transcriptional regulator  56.83 
 
 
182 aa  228  5e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2172  transcriptional regulator, TetR family  59.89 
 
 
185 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046251 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3184  TetR family transcriptional regulator  56.61 
 
 
186 aa  225  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2005  transcriptional regulator, TetR family  60.96 
 
 
193 aa  214  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.848045  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5272  TetR family transcriptional regulator  64.24 
 
 
173 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.118742  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  52.49 
 
 
197 aa  190  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  39.69 
 
 
200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.67022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5143  transcriptional regulator  39.33 
 
 
200 aa  125  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal  0.0526166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 
192 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  39.27 
 
 
192 aa  123  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8534  transcriptional regulator, TetR family  38.86 
 
 
201 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  39.46 
 
 
193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1426  transcriptional regulator, TetR family  41.49 
 
 
190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0427  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 
180 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0084  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
205 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1602  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 
191 aa  117  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2116  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6000  TetR family transcriptional regulator  40.64 
 
 
180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513273  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 
192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3941  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 
222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2973  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0965425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3797  regulatory protein TetR  39.04 
 
 
180 aa  115  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.350305  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4120  transcriptional regulator, TetR family  39.04 
 
 
180 aa  114  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3096  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
213 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.631067  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  39.57 
 
 
194 aa  111  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3608  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 
198 aa  111  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4962  transcriptional regulator, TetR family  37.19 
 
 
196 aa  110  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0320648  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1188  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5341  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
194 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601109  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0195  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
194 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.5282  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  38.58 
 
 
193 aa  107  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3303  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
221 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.808306 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4799  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
195 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
196 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2441  TetR family transcriptional regulator  38.58 
 
 
193 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.509096 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
203 aa  105  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  36.98 
 
 
186 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6374  putative transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 
191 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3577  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
218 aa  101  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5405  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
195 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4813  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
195 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800631  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5456  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
195 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.31437 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4322  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
198 aa  99  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136212  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1766  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
196 aa  98.2  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390977  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0539  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
201 aa  97.8  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  35.1 
 
 
204 aa  97.1  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3233  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 
193 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
190 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5097  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
188 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4903  putative TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
200 aa  95.5  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021531  normal  0.0222673 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
206 aa  94.7  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5110  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 
205 aa  92.4  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2995  TetR family transcriptional regulator  43.57 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  33.52 
 
 
186 aa  89.4  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2526  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 
252 aa  89.4  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 
190 aa  89  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2699  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 
197 aa  89  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
228 aa  86.7  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6204  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
199 aa  86.3  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0171  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
189 aa  85.9  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0107  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
199 aa  85.5  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267531  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
201 aa  85.9  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4385  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
201 aa  85.1  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4582  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
191 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278118  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
195 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0741  regulatory protein, TetR  31.38 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  42.34 
 
 
190 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4681  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0696  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
194 aa  81.3  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4037  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0431559  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0068  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
193 aa  79  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1221  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.342861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1758  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3383  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6064  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2732  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1617  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1392  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.637203  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2556  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2643  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3196  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
293 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.431019  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2503  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2118  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  28.65 
 
 
191 aa  72  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 
199 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal 
 
 
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NC_007651  BTH_I1974  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36617  n/a   
 
 
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NC_011368  Rleg2_4587  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358268  normal 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1999  putative transcriptional regulator  36.15 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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