More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0539 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0539  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  397  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 194 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5110  TetR family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 205 aa  141  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 200 aa  132  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67022 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0195  TetR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.5282  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3184  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 186 aa  123  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2276  TetR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 182 aa  120  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2480  TetR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  37.19 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3648  TetR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5097  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2172  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 185 aa  111  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046251 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2441  TetR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 193 aa  111  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.509096 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3941  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2017  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.93886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3577  TetR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5341  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4799  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 195 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2116  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3096  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.631067  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5405  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4737  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 209 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.838213 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5456  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.31437 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4813  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800631  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2933  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0101224  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0427  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 193 aa  102  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 192 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2168  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 188 aa  102  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2719  regulatory protein, TetR  35.75 
 
 		 193 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111608  normal  0.97579 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4322  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 198 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136212  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3303  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 221 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.808306 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4120  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 180 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3797  regulatory protein TetR  35.79 
 
 		 180 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.350305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1188  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 193 aa  95.5  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4903  putative TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 200 aa  94.7  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021531  normal  0.0222673 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6000  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 180 aa  92  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3608  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 198 aa  91.7  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2005  transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 		 193 aa  91.7  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.848045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2973  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 211 aa  91.3  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0965425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4962  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0320648  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1758  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 189 aa  89  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5143  transcriptional regulator  28.36 
 
 		 200 aa  88.6  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal  0.0526166 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 190 aa  88.6  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4582  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 191 aa  87.8  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 228 aa  85.5  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 204 aa  85.1  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 190 aa  84.7  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4385  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8534  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010571  Oter_2526  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3634  regulatory protein, TetR  25.89 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.247606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  32.81 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6374  putative transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0741  regulatory protein, TetR  31.77 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0084  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6204  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1426  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620095 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1766  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390977  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4037  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0431559  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0107  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267531  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2626  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1221  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1879  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3233  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3383  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2699  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5358  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4681  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  32.79 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2995  TetR family transcriptional regulator  56.9 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5272  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.118742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1602  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23590  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0142024 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1999  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2732  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2880  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.924779 
 
 
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NC_003910  CPS_0171  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 189 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_2384  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007336  Reut_C6064  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_2810  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.933916 
 
 
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NC_010322  PputGB1_2902  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.465511  normal  1 
 
 
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NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
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NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0298  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal  1 
 
 
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