More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5097 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010335  Caul_5097  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 194 aa  130  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0539  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67022 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4322  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 198 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136212  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0084  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 197 aa  101  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 192 aa  99  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 192 aa  99  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2441  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 193 aa  97.8  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.509096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0427  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 180 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1188  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  97.8  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3184  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2168  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 188 aa  97.1  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8534  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2276  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2933  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0101224  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3648  TetR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2719  regulatory protein, TetR  33.51 
 
 		 193 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111608  normal  0.97579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2480  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 198 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4737  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.838213 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 191 aa  92  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0195  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 194 aa  91.7  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.5282  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6000  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 180 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2017  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 184 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.93886 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 190 aa  91.3  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2172  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 185 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046251 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5110  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 205 aa  89.4  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3797  regulatory protein TetR  36.22 
 
 		 180 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.350305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 193 aa  89  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6204  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 228 aa  88.2  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5405  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 195 aa  87.8  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 190 aa  87.8  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3577  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 218 aa  87  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5143  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal  0.0526166 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4813  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 195 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5456  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 195 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.31437 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4120  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 180 aa  87  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 199 aa  85.9  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0107  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 199 aa  85.5  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267531  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2973  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0965425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3233  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3941  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5341  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4903  putative TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021531  normal  0.0222673 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4799  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4385  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2005  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.848045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2116  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4587  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4681  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3096  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.631067  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3303  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.808306 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0068  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0741  regulatory protein, TetR  30.77 
 
 		 211 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2732  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3608  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0298  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4962  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0320648  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1766  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390977  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1999  putative transcriptional regulator  34.62 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  30.98 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6374  putative transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28320  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.115035  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3383  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23590  putative transcriptional regulator  34.07 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0142024 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0171  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6064  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  27.87 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5358  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1509  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0671702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2384  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3196  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.431019  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1541  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.932149  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2643  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2556  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1978  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0203016  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2503  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3782  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.59056  normal  0.419733 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2118  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1392  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.637203  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1617  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1879  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1602  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2880  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 187 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.924779 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1426  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620095 
 
 
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NC_010552  BamMC406_5272  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.118742  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_1221  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342861 
 
 
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NC_011989  Avi_0652  Transcriptional regulator protein  27.98 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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